280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4844 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.71 
 
 
277 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  51.26 
 
 
277 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  52.71 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  50.54 
 
 
286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  51.9 
 
 
285 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  52.31 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  52.35 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  51.26 
 
 
275 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  49.64 
 
 
284 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  49.64 
 
 
284 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  49.1 
 
 
274 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  48.74 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  50.36 
 
 
282 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.38 
 
 
275 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.38 
 
 
354 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.38 
 
 
275 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  48.38 
 
 
275 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.38 
 
 
275 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  49.46 
 
 
274 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.38 
 
 
275 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.01 
 
 
325 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  49.46 
 
 
274 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.29 
 
 
274 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  48.38 
 
 
274 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  45.07 
 
 
280 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  48.74 
 
 
274 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  48.74 
 
 
274 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  46.32 
 
 
275 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  43.45 
 
 
284 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  44.17 
 
 
278 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  47.08 
 
 
276 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  41.15 
 
 
265 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  44.19 
 
 
275 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  46.62 
 
 
270 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  40.64 
 
 
278 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  41.48 
 
 
266 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  44.57 
 
 
275 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  41.26 
 
 
270 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  42.74 
 
 
239 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  42.74 
 
 
239 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  42.35 
 
 
276 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
274 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  39.78 
 
 
283 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  31.92 
 
 
274 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  36.4 
 
 
287 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
282 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  36.61 
 
 
282 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  41.83 
 
 
274 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  31.97 
 
 
274 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  54.76 
 
 
140 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  31.97 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  36.06 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  38.79 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
266 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  32.8 
 
 
268 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
247 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.73 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.73 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.28 
 
 
275 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.56 
 
 
271 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  35.4 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.82 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  33.92 
 
 
269 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  34.84 
 
 
245 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.44 
 
 
275 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  27.09 
 
 
279 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  30.51 
 
 
272 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  31.22 
 
 
272 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  34.82 
 
 
259 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
245 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
247 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.95 
 
 
279 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.3 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  26.24 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.81 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  25.97 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.1 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.68 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.07 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  32.54 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  32.4 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.07 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.13 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  27.13 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  27.13 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.13 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.93 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  29.36 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.27 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.98 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.68 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.57 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  35.42 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.61 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>