224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0317 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  96 
 
 
275 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  81.45 
 
 
275 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  81.82 
 
 
275 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  78.55 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  77.09 
 
 
275 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  76.73 
 
 
299 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  76.59 
 
 
280 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  71.27 
 
 
275 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  71.27 
 
 
275 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  71.27 
 
 
275 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  71.27 
 
 
275 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  71.27 
 
 
275 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  70.55 
 
 
275 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  70.55 
 
 
275 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  69.45 
 
 
274 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  68.36 
 
 
275 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  48.51 
 
 
276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  49.26 
 
 
274 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  51.33 
 
 
272 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  48.87 
 
 
268 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  49.62 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  44.83 
 
 
278 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  43.73 
 
 
279 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  43.73 
 
 
279 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  43.73 
 
 
279 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  46.18 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  42.65 
 
 
279 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  41.94 
 
 
279 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  43.37 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  41.58 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  44.15 
 
 
278 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.64 
 
 
279 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.07 
 
 
279 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  45.72 
 
 
269 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  46.33 
 
 
256 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  39.62 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  40.96 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  44.11 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  43.91 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  42.86 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  41.76 
 
 
268 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  42.91 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  41.44 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  41.06 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  41.06 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  42.28 
 
 
259 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  42.59 
 
 
267 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  39.27 
 
 
266 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  40.46 
 
 
270 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  39.75 
 
 
266 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  37.69 
 
 
271 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  37.55 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  36.14 
 
 
251 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
279 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  30.71 
 
 
279 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  31.8 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  37.38 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  33.6 
 
 
244 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.28 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  35.38 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  29.68 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  27.45 
 
 
279 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
270 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
276 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  33.46 
 
 
253 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  30.62 
 
 
276 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
266 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  34.18 
 
 
280 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  30.37 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  30.37 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.93 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  31.8 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.58 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
277 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.47 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.68 
 
 
237 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  30.15 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  34.55 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
247 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.35 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>