209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0587 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  50 
 
 
282 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  49.66 
 
 
287 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  37.64 
 
 
275 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  37.27 
 
 
275 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  36.9 
 
 
275 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
274 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
274 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  36.64 
 
 
286 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.56 
 
 
325 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
275 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
274 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  35.19 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.19 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
274 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  35.61 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
274 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
274 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  34.33 
 
 
276 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  34.08 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  36.06 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  36.12 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  37.14 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
277 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  34.31 
 
 
239 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  34.31 
 
 
239 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.58 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  34.52 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  38.02 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  30.74 
 
 
275 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  31.5 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
270 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
247 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  37.89 
 
 
274 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  32.77 
 
 
266 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
284 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
266 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  28.91 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
274 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
274 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  29.64 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  34.56 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
278 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  30.4 
 
 
270 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  25.97 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  24.81 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  35.62 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  31.15 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  32.79 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  35.47 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  28.09 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  28.57 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  29.22 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.59 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8888  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.84 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.84 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  27.93 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.84 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.79 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.32 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  26.78 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  29.29 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.84 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  24.19 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  27.27 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.91 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  26.27 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  25.11 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.24 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  25.99 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  27.51 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.91 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  28.27 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.91 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.66 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>