185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3152 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  91.24 
 
 
274 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  82.12 
 
 
274 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
253 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
268 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  37.64 
 
 
273 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  35 
 
 
274 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
277 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
286 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  36.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
354 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.63 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.8 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  34.98 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  35.5 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
274 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  34.1 
 
 
275 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
275 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  36.28 
 
 
274 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  34.6 
 
 
276 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  33.85 
 
 
275 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  35.68 
 
 
275 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  33.7 
 
 
285 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  33.62 
 
 
266 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
278 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  34.9 
 
 
282 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  36.52 
 
 
274 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  35.84 
 
 
274 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  35.84 
 
 
274 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.04 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  33.94 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  34.96 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  35.81 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
277 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  33.99 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  34.55 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  32.05 
 
 
284 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
266 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  34.45 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
239 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
239 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  33.58 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  33.47 
 
 
280 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.48 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  32.14 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  30 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  31.5 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  28.8 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  28.57 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.5 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  30.26 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  28.23 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30.61 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.26 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.99 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  28.74 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  30.46 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  28.14 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  30.37 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  30.26 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.14 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  35.67 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.67 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8888  metallophosphoesterase  28.02 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.7 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.81 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  28.02 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.77 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  30.77 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>