238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1795 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  88.65 
 
 		 284 aa  503  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  87.59 
 
 		 284 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.19 
 
 		 354 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.19 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.19 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.19 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.19 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  53.19 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.48 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.84 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  54.64 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  50.53 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  50.35 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  50.71 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  50.71 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  50.35 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  49.29 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  52.86 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  49.82 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  49.65 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  49.65 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  50.36 
 
 		 290 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  50.89 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  49.29 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  46.76 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  45.36 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.68 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  45.55 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  44.96 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  46.07 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  46.95 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  45.36 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  45.55 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  46.43 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  41.91 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  43.4 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  43.4 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  37 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  40 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  41.41 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  42.11 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  37.55 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  58.78 
 
 		 140 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  39.86 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  39.85 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  31.39 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  31.02 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  36.63 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  35.04 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  37.14 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  32.09 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  37.59 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  32.8 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  33.96 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  36.05 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  33.46 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  32.08 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  31.05 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  34.95 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  33.94 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  33.21 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  34.22 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.32 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  33.09 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  27.6 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  32.74 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  26.3 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  30.36 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.17 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  30.04 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.88 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  30.47 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  25.56 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.76 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.39 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.26 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  27.53 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.14 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  22.81 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08610  predicted phosphohydrolase  33.04 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  26.01 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  27.53 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.84 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.76 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  31.14 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  28.82 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  29.81 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  30.37 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3291  metallophosphoesterase  31.47 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00054104  normal  0.0184462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  24.7 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  27.5 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.63 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>