180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0094 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  41.85 
 
 
277 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  42.64 
 
 
253 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  39.3 
 
 
274 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  40.86 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  40.93 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
274 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
274 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  36.89 
 
 
266 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  36.03 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.03 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.16 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  34.63 
 
 
275 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  33.85 
 
 
275 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  37.02 
 
 
275 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  35.59 
 
 
275 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
278 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  32.92 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  35.59 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  34.25 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  33.74 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
286 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
239 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
239 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
285 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  35.52 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
274 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  34.14 
 
 
274 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
286 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
287 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
274 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
284 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.65 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  34.17 
 
 
284 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.96 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  32.74 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.03 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  33.2 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  33.72 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  31.66 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  33.33 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.16 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  30.37 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  28.69 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
274 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  28.69 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  26.56 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.75 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  28.8 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  29.06 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.75 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.65 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  28.45 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  28.99 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.65 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  27.72 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  31.68 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  32.02 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  29.44 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  28.02 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.17 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.47 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  33.56 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  30 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.63 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.98 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  29.71 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.01 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  25.12 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  35.24 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.09 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>