More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0490 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  94.58 
 
 
277 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  52.71 
 
 
290 aa  294  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  48.56 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  47.83 
 
 
275 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  47.46 
 
 
275 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.93 
 
 
275 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  46.93 
 
 
275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.93 
 
 
275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.93 
 
 
354 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.93 
 
 
275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.93 
 
 
275 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.57 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  45.29 
 
 
274 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.85 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  47.81 
 
 
285 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  46.38 
 
 
286 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  43.48 
 
 
274 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  45.13 
 
 
275 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  44.2 
 
 
274 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  45.29 
 
 
278 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  44.2 
 
 
274 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  44.2 
 
 
274 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  46.79 
 
 
280 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  44.69 
 
 
284 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  44.04 
 
 
274 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  45.45 
 
 
286 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  43.68 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  44.21 
 
 
284 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  44.17 
 
 
284 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  45.11 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  42.75 
 
 
278 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  45.68 
 
 
282 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  44.36 
 
 
275 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  41.76 
 
 
276 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  47.26 
 
 
239 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  47.26 
 
 
239 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  39.71 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
274 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  38.52 
 
 
274 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
270 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  39.78 
 
 
276 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  41.11 
 
 
283 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  37.83 
 
 
270 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  34.81 
 
 
273 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
274 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  39.26 
 
 
274 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  38.97 
 
 
282 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
287 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  56.56 
 
 
140 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  34.64 
 
 
282 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  35.46 
 
 
266 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
247 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  35.75 
 
 
253 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
313 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
274 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  33.03 
 
 
318 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.11 
 
 
268 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
266 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
245 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  30.49 
 
 
245 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  30.97 
 
 
273 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
268 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  32.08 
 
 
266 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.96 
 
 
275 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  32.76 
 
 
265 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.41 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.49 
 
 
275 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  29.75 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.41 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  31.88 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  32.79 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  29.09 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6761  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0168708  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  32.29 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  30.99 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  31.67 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.75 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  29.46 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  32.63 
 
 
246 aa  89  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
270 aa  89  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.69 
 
 
275 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.33 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.62 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  29.11 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  29.11 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  29.28 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.93 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>