272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1113 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  93.43 
 
 
274 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  97.81 
 
 
274 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  90.88 
 
 
274 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  92.34 
 
 
274 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  92.34 
 
 
274 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  91.97 
 
 
274 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.56 
 
 
275 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.56 
 
 
354 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.2 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.56 
 
 
275 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  79.56 
 
 
275 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.56 
 
 
275 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.56 
 
 
275 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.2 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  73.09 
 
 
275 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  73.09 
 
 
275 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  67.64 
 
 
275 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  54.38 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  52.55 
 
 
286 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  52.16 
 
 
286 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  48.23 
 
 
284 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  47.87 
 
 
284 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  50.71 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  49.82 
 
 
290 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  48.91 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  48.31 
 
 
275 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.4 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  47.1 
 
 
278 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  47.64 
 
 
284 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  46.21 
 
 
280 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  43.48 
 
 
277 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  49.44 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  45.32 
 
 
278 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  43.59 
 
 
276 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  42.64 
 
 
266 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
239 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
239 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
265 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  41.64 
 
 
270 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  44.91 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
282 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
274 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  42.96 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  42.44 
 
 
274 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  38.25 
 
 
287 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
273 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  36.63 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  34.16 
 
 
276 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  56.35 
 
 
140 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  35.19 
 
 
266 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  36.76 
 
 
247 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  34.77 
 
 
268 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  36.48 
 
 
287 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  36.96 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
309 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  35.47 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  32.79 
 
 
313 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
273 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  35.37 
 
 
245 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  36.84 
 
 
244 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  34.62 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  34.2 
 
 
318 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
245 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3291  metallophosphoesterase  37.68 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00054104  normal  0.0184462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  33.03 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.36 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  32.57 
 
 
266 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  31.95 
 
 
266 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  30.12 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  31.94 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  34.56 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  32.92 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  33.49 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  32.5 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  33.46 
 
 
247 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  31.65 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.04 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.56 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.33 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0651  metallophosphoesterase  32.91 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8888  metallophosphoesterase  36.17 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  31.02 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  32.14 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.88 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>