262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4042 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  86.69 
 
 
278 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  80.58 
 
 
284 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  74.91 
 
 
275 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  69.53 
 
 
280 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  49.64 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  44.57 
 
 
277 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  46.93 
 
 
275 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  46.74 
 
 
274 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.29 
 
 
277 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  46.93 
 
 
275 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.65 
 
 
274 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  45.29 
 
 
274 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  46.74 
 
 
274 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  45.85 
 
 
275 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  44.17 
 
 
290 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  46.38 
 
 
274 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  45.65 
 
 
274 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  45.65 
 
 
274 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.93 
 
 
325 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  43.51 
 
 
284 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  45.29 
 
 
274 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.57 
 
 
354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.57 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  44.57 
 
 
275 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.57 
 
 
275 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.57 
 
 
275 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.57 
 
 
275 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  43.16 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  43.33 
 
 
286 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  42.18 
 
 
286 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  43.98 
 
 
266 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  46.07 
 
 
282 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  42.7 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  45.15 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  45.15 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  38.2 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  41.35 
 
 
270 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  40.15 
 
 
275 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  44.21 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
275 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
270 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  32.71 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  36.63 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  33.08 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  35.02 
 
 
253 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
274 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  38.69 
 
 
266 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  36.47 
 
 
247 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  32.21 
 
 
266 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  34.36 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  33.74 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  34.02 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  34.52 
 
 
245 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  34.43 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  32.91 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  34.4 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
245 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  35.92 
 
 
275 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  34.91 
 
 
269 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  42.74 
 
 
140 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  34.55 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
245 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
271 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  34.52 
 
 
275 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
287 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
277 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  31.06 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  32.71 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.82 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  30.77 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.82 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  33.94 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  37.69 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.29 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.92 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  32.5 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  32 
 
 
266 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.21 
 
 
279 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0651  metallophosphoesterase  33.63 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.28 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.28 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.28 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.28 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.28 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>