166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3876 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  35.59 
 
 
268 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  33.99 
 
 
285 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
286 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
274 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  37.06 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  32.06 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.26 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  30.87 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
354 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  31.85 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  30.7 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
274 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.45 
 
 
325 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  35.67 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  35.67 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  34.58 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  33.93 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  30.4 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
278 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  35.05 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  30 
 
 
274 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  31.5 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  30.33 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  31.13 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  30.35 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  31.48 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.05 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  30 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.77 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.41 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.41 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  31.28 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  29.9 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.21 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  29.06 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.24 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.19 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.61 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.35 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  33.53 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  33.33 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.77 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.05 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.73 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  29.47 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.97 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.87 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.62 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.1 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.62 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  24.1 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  24.1 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  24.1 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.69 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  24.88 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6761  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0168708  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.62 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  30 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  25.37 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  27.85 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  30.34 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>