181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3329 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  75.27 
 
 
279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  73.12 
 
 
279 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  73.12 
 
 
279 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  73.48 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  72.76 
 
 
278 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  71.68 
 
 
279 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  71.68 
 
 
279 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  71.68 
 
 
279 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  72.04 
 
 
279 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  71.68 
 
 
279 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  69.18 
 
 
279 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  67.74 
 
 
279 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  68.82 
 
 
279 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  67.74 
 
 
279 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  63.08 
 
 
279 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.32 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  41.33 
 
 
275 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.49 
 
 
274 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  41.22 
 
 
271 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  41.33 
 
 
275 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.75 
 
 
272 aa  218  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  44.07 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.59 
 
 
275 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.59 
 
 
299 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  39.77 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  38.6 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.33 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  40.84 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  41.22 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.07 
 
 
275 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
275 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.64 
 
 
275 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.64 
 
 
275 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.64 
 
 
275 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  42.8 
 
 
275 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.64 
 
 
275 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.64 
 
 
275 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  42.44 
 
 
275 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.96 
 
 
275 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  38.87 
 
 
268 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  38.75 
 
 
268 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.07 
 
 
274 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  39.03 
 
 
271 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  39.18 
 
 
266 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  39.46 
 
 
256 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  38.81 
 
 
266 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  38.2 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  37.92 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  41.53 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  38.43 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  41.13 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  41.51 
 
 
267 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  39.77 
 
 
266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  36.26 
 
 
270 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
266 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  34.5 
 
 
266 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  35.58 
 
 
271 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  35.6 
 
 
251 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  31.91 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  33.59 
 
 
263 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
244 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  31.89 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  26.97 
 
 
279 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.46 
 
 
340 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.1 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.08 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  28.57 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  29.53 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  24.51 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
250 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  25.4 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  25.76 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  25 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  23.74 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  24.14 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.2 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  27 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  23.65 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  24.37 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>