154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0173 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  100 
 
 
273 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  76.28 
 
 
274 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  40.93 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  36.5 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  37.64 
 
 
274 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  36.88 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  32.84 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  38.36 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  37.86 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  34.4 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  33.79 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  32.88 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  36.57 
 
 
285 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  35.58 
 
 
275 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  32.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.57 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.8 
 
 
354 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.97 
 
 
277 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.8 
 
 
325 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
277 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
274 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
274 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  37.27 
 
 
287 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  32.11 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  34.1 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  31.5 
 
 
282 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  31.31 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  30.66 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  35.62 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  31.42 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  35.11 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.37 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  27.64 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  31.25 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  28.91 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  31.41 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.32 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  30.89 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  29.58 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.27 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  29.58 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  28.26 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  26.8 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  30.72 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  27.44 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.32 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.15 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.51 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  28.35 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3291  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00054104  normal  0.0184462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  26.8 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  28.71 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
244 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  25.84 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25 
 
 
299 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.13 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  24.62 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.23 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  30.73 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  28.99 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.63 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.63 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  23.37 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>