More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1269 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  74.91 
 
 		 278 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  74.55 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  74.91 
 
 		 278 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  67.74 
 
 		 280 aa  362  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  51.1 
 
 		 276 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  50.18 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  49.47 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  49.28 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.19 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  47.69 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  48.38 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  46.32 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  48.19 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.13 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  48.74 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  43.32 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.2 
 
 		 325 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  43.51 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.1 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  45.29 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.84 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  46.49 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.1 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  47.1 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.1 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  47.1 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  43.51 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  48.38 
 
 		 274 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  48.38 
 
 		 274 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  43.7 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  47.65 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  45.49 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  45 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  46.38 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  46.38 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  44.95 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  40.07 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  41.35 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  39.18 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  41.79 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  40.3 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  33.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  36.9 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  32.34 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  33.21 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  38.25 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  32.08 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  38.16 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  36.89 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  36.5 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  34.47 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  33.2 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  37.93 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  34.94 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  36.11 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  31.45 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  35.59 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  45.74 
 
 		 140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  36.76 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  34.98 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  34.08 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  34.12 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  36.79 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  32.71 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  30.74 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  33.33 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  33.6 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  35.38 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  34.1 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  30.94 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  30.42 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  31.62 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  30.63 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  27.11 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  31.75 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.11 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  38 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  33.07 
 
 		 245 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  32.65 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  33.18 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.74 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.06 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  35.2 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  33.74 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.57 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  36.03 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.36 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>