247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1455 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  95.77 
 
 
284 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  87.59 
 
 
282 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  54.2 
 
 
286 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  50.88 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  51.06 
 
 
275 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50.71 
 
 
274 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  51.06 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.06 
 
 
275 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  49.29 
 
 
274 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  52.14 
 
 
285 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  47.87 
 
 
274 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  48.58 
 
 
274 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  49.64 
 
 
290 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  48.23 
 
 
274 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  48.41 
 
 
275 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  49.82 
 
 
286 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  48.58 
 
 
274 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  48.58 
 
 
274 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  48.23 
 
 
274 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  44.52 
 
 
284 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  43.51 
 
 
275 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.21 
 
 
277 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  43.16 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  42.81 
 
 
278 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  42.76 
 
 
277 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  44.06 
 
 
280 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  45.62 
 
 
275 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
276 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  44.16 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  42.37 
 
 
239 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  42.37 
 
 
239 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
265 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  38.38 
 
 
283 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  39.29 
 
 
270 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  36.82 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  39.47 
 
 
270 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  61.16 
 
 
140 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
274 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  34.81 
 
 
287 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
282 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  35.61 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  37.68 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  32.84 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  31.73 
 
 
274 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  34 
 
 
266 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
309 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
268 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  33.63 
 
 
318 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  35.41 
 
 
277 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  35.13 
 
 
274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
313 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  35.24 
 
 
287 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  34.55 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  30.97 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  29.7 
 
 
244 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  33.09 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  32.3 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.2 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.65 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  30.36 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.04 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.79 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  30.48 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  26.59 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.02 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08610  predicted phosphohydrolase  30.6 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.55 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.81 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  24.42 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.19 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.72 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  27.5 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.19 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.42 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3291  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00054104  normal  0.0184462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  28.37 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.23 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  25 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.42 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>