178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0777 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  79.93 
 
 
279 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  76.34 
 
 
279 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  74.55 
 
 
279 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  74.91 
 
 
279 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  74.91 
 
 
279 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  76.7 
 
 
279 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  73.48 
 
 
279 aa  447  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  73.48 
 
 
278 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  72.4 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  67.74 
 
 
279 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  68.46 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  58.78 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  44.03 
 
 
275 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.01 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.65 
 
 
275 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  42.65 
 
 
275 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  39.07 
 
 
275 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  42.29 
 
 
275 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.44 
 
 
275 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  39.78 
 
 
275 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  38.35 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  41.94 
 
 
275 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.29 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.91 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.82 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.5 
 
 
275 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.5 
 
 
275 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  44.74 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  44.12 
 
 
272 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  44.36 
 
 
268 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  42.58 
 
 
280 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  40.07 
 
 
272 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  39.26 
 
 
269 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  39.19 
 
 
272 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  38.58 
 
 
271 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  37.64 
 
 
271 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  38.26 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  38.58 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  37.92 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  38.66 
 
 
266 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  38.31 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  37.08 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  37.55 
 
 
266 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  38.95 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  38.28 
 
 
270 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  37.22 
 
 
266 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  36.02 
 
 
266 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  38.65 
 
 
266 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  36.33 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
251 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  31.56 
 
 
265 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  31.66 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  31.17 
 
 
279 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  30.47 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  27.78 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
279 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.83 
 
 
267 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.69 
 
 
340 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  28.81 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.97 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  25.2 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  30 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
278 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  28.7 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.82 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  33.99 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  26.36 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  25 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  23.87 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  22.87 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  25.63 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  24.54 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>