77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1990 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1990  metallophosphoesterase  100 
 
 
747 aa  1455    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  20.67 
 
 
616 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
270 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  25 
 
 
290 aa  54.7  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.08 
 
 
392 aa  54.7  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
285 aa  54.3  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
282 aa  53.9  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
270 aa  53.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
369 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
314 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
335 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
312 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.14 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 
383 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
314 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  25.48 
 
 
290 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
286 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  25.08 
 
 
361 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.32 
 
 
393 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  30 
 
 
357 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  38.81 
 
 
379 aa  48.5  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.89 
 
 
393 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.63 
 
 
395 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.04 
 
 
392 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.18 
 
 
393 aa  48.5  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
382 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
313 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
364 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
318 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  34 
 
 
258 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.73 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.93 
 
 
393 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.9 
 
 
392 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  25.81 
 
 
1138 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.61 
 
 
392 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.61 
 
 
392 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.61 
 
 
392 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  25.19 
 
 
314 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  27.14 
 
 
278 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  26.83 
 
 
608 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  33.7 
 
 
366 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  45.83 
 
 
383 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  23.41 
 
 
680 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  25.2 
 
 
384 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
277 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.8 
 
 
384 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7900  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.72 
 
 
484 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
274 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  25.64 
 
 
400 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  24.28 
 
 
281 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  38.14 
 
 
436 aa  45.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
366 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  31.25 
 
 
396 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
319 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
314 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  36.96 
 
 
304 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.83 
 
 
385 aa  45.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  23 
 
 
304 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  24.18 
 
 
628 aa  44.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.85 
 
 
393 aa  44.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
239 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
239 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  21.01 
 
 
343 aa  44.3  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  50 
 
 
275 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  28.19 
 
 
384 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.18 
 
 
392 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>