152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4607 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  100 
 
 
314 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  98.09 
 
 
314 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  93.31 
 
 
314 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  92.04 
 
 
314 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  92.04 
 
 
314 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  92.04 
 
 
314 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  86.05 
 
 
312 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  76.04 
 
 
314 aa  497  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  75.72 
 
 
314 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  52.46 
 
 
314 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  50.5 
 
 
319 aa  319  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  52.29 
 
 
313 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  51.32 
 
 
313 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  53.4 
 
 
335 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  51.72 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  49.22 
 
 
320 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  53.75 
 
 
318 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  44.95 
 
 
314 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  39.15 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  36.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.62 
 
 
306 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.28 
 
 
299 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.28 
 
 
299 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 
296 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  37.23 
 
 
295 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.9 
 
 
229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
382 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  28.9 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  31.05 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
611 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  29.13 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.31 
 
 
274 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  28.36 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.52 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.52 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.33 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 
275 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
289 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
774 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  25.47 
 
 
820 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25.59 
 
 
819 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25 
 
 
820 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0777  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.89 
 
 
824 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0726  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.89 
 
 
824 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0815  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.89 
 
 
819 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
276 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
357 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  26.23 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0712  phosphohydrolase  25.12 
 
 
824 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  24.02 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  25.68 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  24.54 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  28 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0911  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25.12 
 
 
819 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30065e-39 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  28 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
680 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  30 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  24.53 
 
 
819 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.53 
 
 
819 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  27.65 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
606 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.95 
 
 
1138 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  23.91 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
269 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>