90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4746 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  63.02 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  57.09 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  60.62 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  56.35 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  54.76 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  55.23 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  61.51 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  50.57 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  45.56 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  43.37 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  38.35 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  38.35 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  37.55 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  36.86 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  37.9 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  40.93 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  39.58 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  39.17 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  32.92 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  37.66 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  35.98 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  34.05 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  35.86 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  35.32 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  31.8 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  24.24 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  23.38 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  30.96 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  27.9 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  26.27 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  22.69 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.73 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  28.64 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  28.64 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  30.69 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  26.34 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  28.29 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  28.29 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  29.5 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  27.14 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  35.44 
 
 		 706 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  25.25 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  22.97 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  40.85 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 		 1818 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  43.66 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  43.66 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  28.03 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  26.6 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  29.25 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  25.76 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  30 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  27.19 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  25.73 
 
 		 726 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  25.52 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  27.87 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  29.29 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  42.25 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  20.86 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  23.33 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_002620  TC0746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.522504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  32.18 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  25.49 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  34.94 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0405  hypothetical protein  22.64 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0600873  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2926  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 387 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000117671  hitchhiker  0.00000962114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>