79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1617 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
229 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
306 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
299 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
306 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  79.25 
 
 
306 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
306 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
299 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  79.25 
 
 
306 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  78.77 
 
 
306 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  68.37 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  65.58 
 
 
309 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  66.04 
 
 
295 aa  286  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
318 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  36.41 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  39.9 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  38.12 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  39.9 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  36.28 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  35.58 
 
 
314 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  41.01 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  34.75 
 
 
313 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  34.55 
 
 
314 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  36.2 
 
 
319 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
314 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
319 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  31 
 
 
382 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
374 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  31.17 
 
 
680 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
313 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
529 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  24.2 
 
 
470 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  33.12 
 
 
551 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
343 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
252 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
594 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  27.69 
 
 
519 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  30.64 
 
 
574 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
659 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  24.17 
 
 
628 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
611 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.22 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  30.57 
 
 
571 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
525 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
616 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  27.78 
 
 
496 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
286 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  24.1 
 
 
607 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5386  metallophosphoesterase  23.2 
 
 
244 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.81 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  27.44 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  23.57 
 
 
521 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  32.18 
 
 
1138 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
270 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25 
 
 
276 aa  45.1  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  26.56 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1782  metallophosphoesterase  24.53 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  24.26 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2363  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
774 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.48 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  31.03 
 
 
820 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
304 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4446  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
387 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  25.29 
 
 
1194 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>