142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2672 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  100 
 
 
313 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  83.17 
 
 
314 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  69.33 
 
 
320 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  67.63 
 
 
313 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  67.96 
 
 
319 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  65.08 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  68.08 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  58.36 
 
 
319 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  51.13 
 
 
314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  54.14 
 
 
314 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  54.14 
 
 
314 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  53.79 
 
 
314 aa  321  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  54.14 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  51.64 
 
 
314 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  51.32 
 
 
314 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  51.64 
 
 
314 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  50.51 
 
 
312 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  47.4 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  42.74 
 
 
309 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  41.1 
 
 
296 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.29 
 
 
306 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  40.23 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
299 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.23 
 
 
299 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 
295 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.45 
 
 
229 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  30.57 
 
 
374 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  26.72 
 
 
382 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  29.53 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  29.11 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  25.54 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  24.65 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  27.63 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  27.63 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  23.18 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
680 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
239 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
239 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
616 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
606 aa  55.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.69 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  26.58 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.27 
 
 
1138 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  24.27 
 
 
369 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  24.07 
 
 
357 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
529 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.88 
 
 
611 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.47 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.53 
 
 
325 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.69 
 
 
275 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.69 
 
 
275 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.69 
 
 
275 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.69 
 
 
275 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
281 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
499 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  23.73 
 
 
470 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  25.85 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
275 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  25 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.27 
 
 
275 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  22.38 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  28.14 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.38 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.38 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.38 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  22.8 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  26.29 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  25.24 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  23.5 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
299 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  23.26 
 
 
819 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
274 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.08 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.86 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  25.63 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
276 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  26.84 
 
 
274 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  22.79 
 
 
819 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  26.84 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  27.88 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  27.6 
 
 
574 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.67 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  24.22 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>