120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0598 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  72.45 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  76.19 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  76.19 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  72.1 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  71.78 
 
 		 295 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.37 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  36.39 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  39.35 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  38.04 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  37.32 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  39.59 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  41.1 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  39.06 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  40.3 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  36.51 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  39.04 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  35.97 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  36.95 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  36.8 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  36.8 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  36.8 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  34.77 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 374 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  30.09 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0908  hypothetical protein  73.33 
 
 		 117 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79622  normal  0.0768341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  27.8 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  29.85 
 
 		 521 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 680 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  24.64 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  28.1 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  27.55 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  32.35 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  32.03 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  28.92 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  30.94 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  28.78 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.81 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  25.44 
 
 		 628 aa  55.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  27.92 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  28.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.01 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  27.52 
 
 		 820 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  27.45 
 
 		 819 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  31.06 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3294  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.24 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.24 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  29.76 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.24 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  32.24 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.24 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.24 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.96 
 
 		 819 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.95 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  28.29 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  26.3 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  28.92 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  26.96 
 
 		 820 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  27.8 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.57 
 
 		 819 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  28.77 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.69 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.95 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  30.91 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  26.98 
 
 		 519 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  30.91 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  29.17 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  25.27 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  32.5 
 
 		 1138 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  28.35 
 
 		 1174 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  29.06 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  28.06 
 
 		 574 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  25.79 
 
 		 607 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0911  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25.49 
 
 		 819 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30065e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0726  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  25.49 
 
 		 824 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0712  phosphohydrolase  25.49 
 
 		 824 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  27.46 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  27.01 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  28.24 
 
 		 1164 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  22.61 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  28 
 
 		 571 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.15 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.15 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>