55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4167 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
1164 aa  2323    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  54.96 
 
 
1174 aa  1171    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.69 
 
 
1138 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
1118 aa  199  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
1327 aa  194  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  25.23 
 
 
1421 aa  171  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  25.62 
 
 
1426 aa  170  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  23.99 
 
 
952 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  24.66 
 
 
929 aa  124  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  24.17 
 
 
913 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  25.97 
 
 
756 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  28.76 
 
 
402 aa  105  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  27.33 
 
 
986 aa  94.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  29.15 
 
 
487 aa  92.8  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  30.08 
 
 
652 aa  88.2  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.6 
 
 
921 aa  85.1  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 
480 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.78 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  22.79 
 
 
594 aa  65.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
343 aa  62  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  23.78 
 
 
833 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  25.27 
 
 
553 aa  59.7  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.13 
 
 
718 aa  59.3  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  33.62 
 
 
383 aa  56.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
303 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  20.61 
 
 
877 aa  52.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  34.43 
 
 
1361 aa  52.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  26.54 
 
 
259 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  24.36 
 
 
644 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3804  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
387 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0698095  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
269 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
486 aa  50.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  25.64 
 
 
270 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 
382 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.09 
 
 
1279 aa  48.9  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
303 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2410  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
274 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0101986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  35.42 
 
 
646 aa  48.5  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2497  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
282 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.29641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  34.52 
 
 
497 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  23.76 
 
 
553 aa  47.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  25.57 
 
 
605 aa  47.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  37.18 
 
 
465 aa  47.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  32.24 
 
 
563 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  32.24 
 
 
540 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  32.24 
 
 
559 aa  46.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  32.24 
 
 
559 aa  46.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  32.24 
 
 
563 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  32.24 
 
 
563 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  45.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  32.24 
 
 
563 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  21.34 
 
 
278 aa  45.4  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
296 aa  45.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  26.26 
 
 
470 aa  45.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  25.08 
 
 
312 aa  44.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>