95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2529 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  100 
 
 
1118 aa  2185    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  53.36 
 
 
1138 aa  1015    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  43.08 
 
 
1327 aa  722    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  39.71 
 
 
1421 aa  618  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  37.27 
 
 
1426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  38.85 
 
 
756 aa  364  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  37.32 
 
 
594 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  33.14 
 
 
986 aa  233  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  27.03 
 
 
1164 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  25.51 
 
 
1174 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  24.95 
 
 
929 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  24.51 
 
 
952 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  36.24 
 
 
402 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.44 
 
 
420 aa  151  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  24.59 
 
 
913 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.82 
 
 
921 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  46.49 
 
 
652 aa  91.3  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 
480 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  24.64 
 
 
877 aa  88.6  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  21.34 
 
 
686 aa  85.5  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  28.53 
 
 
642 aa  80.9  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.17 
 
 
718 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.82 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  28.01 
 
 
625 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  34.82 
 
 
303 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  28.11 
 
 
625 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  28.47 
 
 
660 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.72 
 
 
833 aa  71.6  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  36.36 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  27.62 
 
 
603 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  28.53 
 
 
605 aa  69.7  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  37.25 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  46.74 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  27.13 
 
 
644 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  34.78 
 
 
328 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  29.23 
 
 
382 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
383 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
611 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  38.98 
 
 
332 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  38.71 
 
 
215 aa  61.6  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
252 aa  61.6  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  26.58 
 
 
514 aa  60.1  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  39.58 
 
 
249 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  27.86 
 
 
561 aa  57.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
382 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  33.61 
 
 
338 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  29.39 
 
 
465 aa  56.2  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  47.62 
 
 
350 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  27.97 
 
 
312 aa  55.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  28.88 
 
 
589 aa  54.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
345 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  43.82 
 
 
346 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  29.97 
 
 
540 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  29.74 
 
 
563 aa  53.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  25.93 
 
 
293 aa  52.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  47.46 
 
 
331 aa  52  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2410  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
274 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0101986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  29.49 
 
 
563 aa  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2497  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
282 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.29641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3804  metallophosphoesterase  26.72 
 
 
387 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0698095  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  38.3 
 
 
365 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  29.23 
 
 
563 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  29.47 
 
 
559 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  29.23 
 
 
563 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  29.47 
 
 
559 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
616 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  44.07 
 
 
203 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  27.47 
 
 
583 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  36.52 
 
 
269 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  39.53 
 
 
259 aa  48.9  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  30.95 
 
 
747 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  42.37 
 
 
322 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  31.41 
 
 
298 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.78 
 
 
338 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2586  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
288 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.309935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
274 aa  47.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
239 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2956  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
281 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0819511  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2768  hypothetical protein  29.24 
 
 
558 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0508  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
267 aa  47.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.236353  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
239 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
278 aa  47  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  47.54 
 
 
296 aa  47  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
374 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  22.3 
 
 
304 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  24.78 
 
 
473 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  25.71 
 
 
497 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  31.61 
 
 
529 aa  47  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30 
 
 
268 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  34.44 
 
 
1361 aa  46.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.09 
 
 
277 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  33.57 
 
 
266 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  26.14 
 
 
259 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  34.15 
 
 
290 aa  45.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>