120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1382 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  100 
 
 
298 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  70.55 
 
 
292 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  68.84 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  67.69 
 
 
293 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  61.46 
 
 
318 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  61.36 
 
 
297 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  60.14 
 
 
301 aa  354  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  45.27 
 
 
303 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  45.42 
 
 
301 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  44.85 
 
 
307 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  44.59 
 
 
303 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  44.93 
 
 
300 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  44.56 
 
 
316 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  46.07 
 
 
302 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  44.56 
 
 
315 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  42.07 
 
 
306 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  43.32 
 
 
300 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  45.23 
 
 
298 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  44.22 
 
 
331 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  45.13 
 
 
302 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  40.07 
 
 
300 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  45.58 
 
 
298 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  44.04 
 
 
302 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  41.28 
 
 
307 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  43.42 
 
 
332 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  43.37 
 
 
307 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  42.29 
 
 
307 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  35.77 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  37.2 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  37.72 
 
 
307 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
309 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  38.21 
 
 
307 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  30.47 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.1 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  31.8 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  30.27 
 
 
274 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  26.84 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.36 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  25.68 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  24.24 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  26.32 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  29.51 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  22.7 
 
 
606 aa  52.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  25.68 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  25.68 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  25.41 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  24.05 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  25.14 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  32.7 
 
 
276 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  26.75 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  31.41 
 
 
1118 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  27.72 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.09 
 
 
263 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
270 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  26.41 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
274 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
473 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  26.63 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.22 
 
 
325 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.2 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.22 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.64 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.2 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  32.2 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.2 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.2 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
369 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>