59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4447 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  100 
 
 
913 aa  1857    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  38.62 
 
 
929 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  32.26 
 
 
952 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  26.75 
 
 
1138 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.8 
 
 
921 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  28.03 
 
 
1426 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
1421 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  25 
 
 
1327 aa  147  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
1118 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  25.97 
 
 
1174 aa  138  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  24.17 
 
 
1164 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  24.44 
 
 
877 aa  111  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  23.96 
 
 
756 aa  102  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  27.75 
 
 
833 aa  98.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  28.12 
 
 
402 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  26.25 
 
 
480 aa  97.8  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.71 
 
 
420 aa  94.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  28.3 
 
 
430 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  34.04 
 
 
986 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  35.48 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.9 
 
 
487 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  25.47 
 
 
718 aa  73.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  26.29 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  26.29 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  26.29 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  26.29 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  26.29 
 
 
563 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  26.29 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
383 aa  67.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  26.76 
 
 
563 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  30.23 
 
 
686 aa  65.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 
486 aa  65.1  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  24.84 
 
 
644 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 
382 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  24.27 
 
 
605 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  24.15 
 
 
514 aa  57.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  44.16 
 
 
346 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  23.67 
 
 
625 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  40.91 
 
 
289 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  23.37 
 
 
625 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  32.61 
 
 
215 aa  53.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  37.78 
 
 
345 aa  53.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  39.19 
 
 
365 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  24.48 
 
 
660 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  24.65 
 
 
603 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  34 
 
 
303 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  37.35 
 
 
259 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  39.19 
 
 
350 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  24.55 
 
 
553 aa  49.3  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  23.64 
 
 
561 aa  48.9  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  23.49 
 
 
642 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  27.5 
 
 
293 aa  48.1  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  21.25 
 
 
497 aa  47.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 
331 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  21.47 
 
 
465 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  36.21 
 
 
203 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  19.63 
 
 
534 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  24.31 
 
 
583 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  43.33 
 
 
296 aa  44.3  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>