77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0002 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  32.16 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  36.92 
 
 		 480 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  29.07 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  27.71 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  28.68 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  32.43 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  42.72 
 
 		 1138 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  47.87 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  37.96 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  36.61 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 559 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 559 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  41.49 
 
 		 540 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 563 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 563 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  51.25 
 
 		 929 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  47 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  46.74 
 
 		 1118 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  41.59 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  44.87 
 
 		 1327 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  55.93 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  31.98 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  38.27 
 
 		 686 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  38.1 
 
 		 833 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  28.45 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  52.46 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  38.98 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  47.06 
 
 		 756 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  27.64 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  27.62 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  37.89 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.59 
 
 		 646 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  48.39 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  35.79 
 
 		 605 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  40.91 
 
 		 913 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  28.43 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  29.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  38.3 
 
 		 644 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  27.38 
 
 		 444 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  43.75 
 
 		 589 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 383 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  33.04 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  33.04 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  29.61 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.88 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  33.68 
 
 		 642 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  38.46 
 
 		 1421 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  45.95 
 
 		 986 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  25.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  25.29 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  36.17 
 
 		 603 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  36.17 
 
 		 625 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  25.52 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  36.17 
 
 		 625 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  27.01 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  33.85 
 
 		 561 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  42.11 
 
 		 921 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  31.91 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  41.38 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  25.85 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  30 
 
 		 553 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 528 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  24.67 
 
 		 553 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  34.48 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  36.17 
 
 		 583 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>