62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2178 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  99.61 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  39.92 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  41.41 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  31.88 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  29.88 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  29.05 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  32.19 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  32.65 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  31.51 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  25.43 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  34 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  27.12 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  27.12 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  29.76 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  26.9 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  27.75 
 
 
248 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  28.9 
 
 
293 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  24.6 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  27.06 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  31.36 
 
 
833 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3953  hypothetical protein  27.11 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.279999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  27.06 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  33.04 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1115  hypothetical protein  26.11 
 
 
282 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  33.98 
 
 
652 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 
444 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  27.38 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  26.34 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1920  hypothetical protein  28.78 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  27.39 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  25.81 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  26.79 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  26.79 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  26.79 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  26.79 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  37.78 
 
 
605 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  26.79 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  28.28 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  36.47 
 
 
877 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.2 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  34.29 
 
 
642 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  25.89 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  25.89 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  25.89 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  32.58 
 
 
952 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  28.3 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  27.67 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  36.63 
 
 
603 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  31.93 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  29.38 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  31.68 
 
 
625 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  33.01 
 
 
660 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  33.02 
 
 
644 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  31.68 
 
 
625 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  26.6 
 
 
718 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  32.41 
 
 
497 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  27.98 
 
 
350 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
383 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  30.7 
 
 
929 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>