63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2255 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  98.51 
 
 
336 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  686    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  44.89 
 
 
346 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  39.82 
 
 
350 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  41.69 
 
 
322 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
338 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  40.25 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  32.75 
 
 
365 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
747 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
345 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  29.07 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.9 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  29.89 
 
 
833 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  40.59 
 
 
430 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  34.31 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  38.02 
 
 
559 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  41.84 
 
 
179 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  38.02 
 
 
559 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  38.02 
 
 
563 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  38.02 
 
 
563 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  30.73 
 
 
540 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  37.19 
 
 
563 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  37.19 
 
 
563 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  31.52 
 
 
1138 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  33.09 
 
 
652 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  35.29 
 
 
686 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  36.52 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  29.06 
 
 
603 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  37.07 
 
 
929 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  32.76 
 
 
718 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  26.51 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  26.51 
 
 
258 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  35.19 
 
 
756 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.65 
 
 
382 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  42.5 
 
 
486 aa  50.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  31.4 
 
 
553 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  31.4 
 
 
553 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  39.77 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  25.81 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  32.46 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  25.81 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
1421 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  41.27 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  31.63 
 
 
605 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  34.52 
 
 
487 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0991  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 
302 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0337023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 
646 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  36.36 
 
 
644 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  26.4 
 
 
1426 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1920  hypothetical protein  26.85 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295043 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  29.94 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  34.33 
 
 
625 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  34.34 
 
 
952 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  34.33 
 
 
625 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  28.57 
 
 
561 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  39.08 
 
 
877 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>