39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1911 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 317 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  47.8 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  47.55 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  46.04 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  43.78 
 
 		 248 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  48 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  45.81 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  47 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  46.5 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  42.66 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  40.6 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  37.11 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  40.55 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  43.52 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  40.22 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  43.52 
 
 		 256 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  43.3 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  45.5 
 
 		 238 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  41.92 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  42.25 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  45.18 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  39.11 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  42.01 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  41.55 
 
 		 245 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  40.54 
 
 		 251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  34.84 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  34.84 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  34.84 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  34.84 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  34.84 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  39.69 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  34.39 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  35.35 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  23.94 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  26.63 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>