64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0026 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  43.16 
 
 
444 aa  195  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  32.79 
 
 
605 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  31.36 
 
 
833 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  30.77 
 
 
660 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  35.45 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  31.15 
 
 
625 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  29.6 
 
 
644 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  31.15 
 
 
625 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  30.58 
 
 
603 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  31.45 
 
 
642 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  33.64 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  24.88 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 
733 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  32.32 
 
 
718 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  59.52 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
466 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  24.31 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  27.61 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  23.08 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  28 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  32.29 
 
 
589 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
249 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  46 
 
 
261 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  50 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  30.2 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  46.34 
 
 
562 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  25.12 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
596 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  30.2 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  28.42 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  31.53 
 
 
583 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  45.45 
 
 
208 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  33.63 
 
 
486 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  40.82 
 
 
546 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  43.55 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0890  hypothetical protein  43.48 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.874622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  39.13 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4949  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.14 
 
 
476 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0480001  normal  0.137764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  25.32 
 
 
921 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4897  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.14 
 
 
476 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019111  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  40.62 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  46.81 
 
 
445 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  37.84 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.14 
 
 
476 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  23.6 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  39.06 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  35.38 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  26.34 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  23.6 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  29.82 
 
 
487 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 
797 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  35 
 
 
495 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  30.48 
 
 
240 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2403  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  45 
 
 
428 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  30.13 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>