59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0890 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0890  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.874622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.15 
 
 		 597 aa  51.6  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  44.19 
 
 		 557 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  44.19 
 
 		 542 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  42.22 
 
 		 563 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  53.66 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.73 
 
 		 637 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.45 
 
 		 593 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.64 
 
 		 455 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.45 
 
 		 631 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  41.03 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 		 576 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  37.21 
 
 		 560 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.9 
 
 		 472 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  43.75 
 
 		 571 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.77 
 
 		 579 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.65 
 
 		 840 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0657  Peptidoglycan-binding LysM  27.81 
 
 		 266 aa  45.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  43.86 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  46.67 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  47.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 797 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.48 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.75 
 
 		 581 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  45.24 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.73 
 
 		 435 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.86 
 
 		 471 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.36 
 
 		 546 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 		 432 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  40.91 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  37.31 
 
 		 473 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 471 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.18 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  29.61 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.64 
 
 		 443 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  46.51 
 
 		 539 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  39.53 
 
 		 471 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  47.73 
 
 		 499 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  40.43 
 
 		 438 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  35.71 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4897  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 476 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 476 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  39.58 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  45.83 
 
 		 448 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  47.62 
 
 		 474 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  70.37 
 
 		 638 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 554 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 		 439 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 733 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 596 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  41.86 
 
 		 264 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 338 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.94 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 379 aa  41.6  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  47.73 
 
 		 389 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 849 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 409 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>