More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2403 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2403  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  100 
 
 		 428 aa  851    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1403  membrane-bound lytic murein transglycosylase  51.89 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  42.47 
 
 		 534 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.92 
 
 		 530 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.63 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41.49 
 
 		 515 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  43.53 
 
 		 539 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41.49 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.23 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.23 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.23 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.23 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.45 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.23 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.24 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.01 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.27 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  42.51 
 
 		 556 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.72 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.02 
 
 		 532 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.16 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  38.75 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  38.68 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.16 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  40.68 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  40.37 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.04 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  42.14 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.83 
 
 		 528 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.27 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.54 
 
 		 543 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  38.94 
 
 		 580 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  35.39 
 
 		 548 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.07 
 
 		 517 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.56 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  37.58 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.58 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 553 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  37.54 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  37.54 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  36.59 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  38.29 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  38.29 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  38.29 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  37.54 
 
 		 483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  42.15 
 
 		 562 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  37.54 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  36.59 
 
 		 474 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 550 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  38.68 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.99 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  38.29 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.68 
 
 		 530 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 		 530 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.68 
 
 		 530 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  43.55 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  37.97 
 
 		 529 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.68 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.68 
 
 		 530 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 471 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 		 530 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 524 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 561 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  37.66 
 
 		 524 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  36.16 
 
 		 518 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 		 529 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  36.59 
 
 		 477 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  35.96 
 
 		 474 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  37.85 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 564 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  36.7 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  36.7 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  41.12 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 		 517 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  35.96 
 
 		 514 aa  202  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  36.09 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  36.57 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  38.01 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  39.32 
 
 		 547 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  34.27 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  34.27 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  37.38 
 
 		 507 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  36.76 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  34.57 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  34.57 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>