51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0635 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  26.79 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  29.06 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.15 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  36.52 
 
 
1138 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  31.18 
 
 
1426 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  25.3 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  27.08 
 
 
756 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  25.19 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  34.86 
 
 
718 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  37.08 
 
 
877 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  28.9 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  25.65 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  35.25 
 
 
929 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  28.9 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
1118 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 
480 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  33.91 
 
 
686 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  30.3 
 
 
952 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.23 
 
 
420 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35.96 
 
 
921 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  32.17 
 
 
553 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  34.43 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
1327 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  37.5 
 
 
652 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  32.17 
 
 
553 aa  49.3  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  22.87 
 
 
646 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  27.5 
 
 
913 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.12 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  25.85 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  40 
 
 
1421 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  28.12 
 
 
605 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  29.9 
 
 
833 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  29.85 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 
625 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  36.21 
 
 
625 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  34.92 
 
 
487 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  36.51 
 
 
559 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  34.85 
 
 
540 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  36.51 
 
 
559 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  36.51 
 
 
563 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  26.13 
 
 
1174 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  36.51 
 
 
563 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  36.51 
 
 
563 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  36.51 
 
 
563 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  31.93 
 
 
402 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  27.84 
 
 
534 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  25.67 
 
 
203 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>