95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3267 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1320    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  35.06 
 
 
1138 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  68.97 
 
 
1643 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3274  5'-Nucleotidase domain protein  66.67 
 
 
775 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.88 
 
 
833 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.06 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  31.55 
 
 
929 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  31.36 
 
 
1426 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  27.18 
 
 
686 aa  105  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  29.53 
 
 
952 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  25.95 
 
 
718 aa  97.8  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 
480 aa  98.2  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  45.38 
 
 
303 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  32.17 
 
 
1118 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
1421 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  30.08 
 
 
1164 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  37.79 
 
 
756 aa  90.5  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.23 
 
 
921 aa  90.5  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
1327 aa  90.5  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  48.96 
 
 
646 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  33.76 
 
 
487 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 
486 aa  88.6  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  29.43 
 
 
430 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  27.69 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  27.52 
 
 
913 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  35.22 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  29.24 
 
 
986 aa  77.8  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  43.62 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.32 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  48.24 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  47.87 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  26.14 
 
 
1174 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  26.19 
 
 
605 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  46.15 
 
 
346 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  37.74 
 
 
215 aa  66.2  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  33.07 
 
 
322 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  42.53 
 
 
540 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  42.53 
 
 
563 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  42.53 
 
 
563 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  35.71 
 
 
350 aa  63.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  41.38 
 
 
563 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  41.38 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  41.38 
 
 
563 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  41.38 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  21.97 
 
 
660 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  26.07 
 
 
553 aa  61.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  39.77 
 
 
249 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  33.82 
 
 
336 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  43.02 
 
 
410 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  24.06 
 
 
625 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  26.05 
 
 
553 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  24.21 
 
 
625 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  33.09 
 
 
336 aa  57.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.06 
 
 
352 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  23.51 
 
 
603 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  42.45 
 
 
296 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  24.81 
 
 
644 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  36.26 
 
 
747 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  35.71 
 
 
365 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  35.96 
 
 
338 aa  54.7  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  35.92 
 
 
332 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  23.72 
 
 
534 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3269  hypothetical protein  35.24 
 
 
247 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  26.75 
 
 
561 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  33.98 
 
 
255 aa  52  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.17 
 
 
801 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  33.98 
 
 
255 aa  52  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.33 
 
 
253 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.33 
 
 
253 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  27.98 
 
 
304 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  27.3 
 
 
528 aa  48.9  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.06 
 
 
803 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  37.5 
 
 
293 aa  48.9  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  31.85 
 
 
602 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  24.91 
 
 
589 aa  47.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  28.71 
 
 
253 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  28.71 
 
 
253 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  30.63 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  40.32 
 
 
259 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.59 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0714  hypothetical protein  29.59 
 
 
132 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  37.84 
 
 
179 aa  46.2  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  42.62 
 
 
561 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  29.7 
 
 
219 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  31.2 
 
 
258 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  28.71 
 
 
253 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  31.2 
 
 
258 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.71 
 
 
253 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>