80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4427 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  53.85 
 
 
1164 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
1174 aa  2337    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  26.89 
 
 
1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
1327 aa  210  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  25.47 
 
 
1118 aa  194  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
1421 aa  180  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  24.7 
 
 
1426 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  25.97 
 
 
913 aa  138  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  26.2 
 
 
952 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  24.54 
 
 
929 aa  119  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  25.78 
 
 
921 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  25.07 
 
 
756 aa  93.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  33.46 
 
 
986 aa  92  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  29.49 
 
 
402 aa  87  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  29.82 
 
 
487 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  24.49 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.08 
 
 
718 aa  75.5  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  26.61 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.62 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
383 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25 
 
 
652 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  34.4 
 
 
275 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  22.49 
 
 
553 aa  58.9  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  28.35 
 
 
1361 aa  58.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
274 aa  56.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
274 aa  56.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
274 aa  56.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  28.24 
 
 
299 aa  55.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
274 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
275 aa  55.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.17 
 
 
833 aa  53.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
486 aa  52.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
313 aa  52.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
274 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
274 aa  52  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.48 
 
 
306 aa  51.6  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  21.25 
 
 
877 aa  51.6  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  23.22 
 
 
343 aa  51.6  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  29 
 
 
470 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2833  metallophosphoesterase  22.07 
 
 
291 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  25.76 
 
 
430 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
259 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.81 
 
 
274 aa  51.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.83 
 
 
496 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  30.86 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  28.87 
 
 
309 aa  50.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
269 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.48 
 
 
299 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.48 
 
 
299 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
275 aa  49.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
275 aa  49.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  31.34 
 
 
275 aa  49.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
325 aa  49.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
354 aa  49.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
275 aa  49.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  25.55 
 
 
605 aa  48.5  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.34 
 
 
275 aa  48.5  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
296 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  32.28 
 
 
274 aa  47.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  21.84 
 
 
553 aa  47.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
275 aa  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  23 
 
 
529 aa  48.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
239 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2410  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
274 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0101986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.49 
 
 
1298 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2497  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
282 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.29641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  32.31 
 
 
382 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
239 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
270 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  22.26 
 
 
497 aa  46.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
289 aa  46.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4760  hypothetical protein  31.71 
 
 
1522 aa  45.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590059  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  30.09 
 
 
646 aa  45.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
492 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  24.34 
 
 
521 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  23.34 
 
 
644 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>