73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3406 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  100 
 
 		 952 aa  1917    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  39.37 
 
 		 929 aa  625  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  32.26 
 
 		 913 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.28 
 
 		 1138 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.82 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  24.42 
 
 		 1421 aa  204  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 1118 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  24.64 
 
 		 1327 aa  166  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  26.12 
 
 		 1426 aa  154  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  26.87 
 
 		 877 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  30.11 
 
 		 402 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  23.86 
 
 		 1164 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  26.2 
 
 		 1174 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  24.26 
 
 		 756 aa  116  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  30.31 
 
 		 833 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.76 
 
 		 718 aa  94  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  27.13 
 
 		 986 aa  92.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  42.86 
 
 		 652 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.12 
 
 		 420 aa  89.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  24.46 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  25 
 
 		 660 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.66 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  25.69 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  23.72 
 
 		 686 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  24.92 
 
 		 644 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  36.59 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  47 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  24.92 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  24.4 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 382 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  39.17 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  25.43 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  39.45 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  24.63 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  33.06 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  23.03 
 
 		 589 aa  55.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  41.33 
 
 		 350 aa  55.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  20.87 
 
 		 497 aa  54.7  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  43.24 
 
 		 346 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  21.77 
 
 		 465 aa  52.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  33.64 
 
 		 528 aa  52.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  23.82 
 
 		 603 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  37.35 
 
 		 259 aa  52  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  29.67 
 
 		 328 aa  52  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  40.91 
 
 		 338 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  38.64 
 
 		 345 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  30.3 
 
 		 293 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  41.03 
 
 		 249 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.71 
 
 		 331 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  47.69 
 
 		 332 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  48.39 
 
 		 296 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  39.24 
 
 		 203 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  23.93 
 
 		 296 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.82 
 
 		 1279 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  22.03 
 
 		 534 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  23.4 
 
 		 514 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  39.66 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  30.83 
 
 		 258 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 352 aa  46.2  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  22.15 
 
 		 583 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  30.83 
 
 		 258 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  45.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  44.7  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  35.48 
 
 		 304 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>