46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1139 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  92.95 
 
 		 553 aa  1032    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1103    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  36.4 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  31.48 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  31.61 
 
 		 561 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  27.86 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  26.63 
 
 		 718 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  27.19 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  25.71 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  28.02 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  25.26 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.77 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  24.63 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  22.38 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  24.36 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  25 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  22.63 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  25 
 
 		 625 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  25.32 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  25.36 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25.9 
 
 		 652 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  21.07 
 
 		 430 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  21.27 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  37.62 
 
 		 350 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  32.23 
 
 		 336 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  31.68 
 
 		 259 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  35.87 
 
 		 365 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  24.13 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  27.07 
 
 		 877 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  31.4 
 
 		 336 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  22.84 
 
 		 589 aa  47.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  23.76 
 
 		 1164 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  24.83 
 
 		 921 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  21.84 
 
 		 1174 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  24.21 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  47  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1920  hypothetical protein  30.93 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  25.4 
 
 		 929 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  31.62 
 
 		 1138 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  24.67 
 
 		 289 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>