21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0878 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1109    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  30.94 
 
 
534 aa  196  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  27.76 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  25 
 
 
553 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  24.39 
 
 
553 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  28.87 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.17 
 
 
514 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  23.83 
 
 
833 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
486 aa  55.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  29.06 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  22.87 
 
 
718 aa  53.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  27.16 
 
 
877 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  34.78 
 
 
365 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  29.17 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  30.58 
 
 
350 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  42.62 
 
 
652 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  24.63 
 
 
561 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  29.46 
 
 
336 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  24.44 
 
 
913 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>