38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1487 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1043    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  38.91 
 
 		 534 aa  363  6e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  32.78 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  31.48 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  27.76 
 
 		 561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  28.48 
 
 		 686 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  23.53 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  26.8 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  25.95 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  24.91 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  24.62 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  23.93 
 
 		 625 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  23.84 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  23.05 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  23.68 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  26.06 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 486 aa  56.2  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  24.17 
 
 		 497 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  25.9 
 
 		 921 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  23.97 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  33.64 
 
 		 952 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  31.6 
 
 		 929 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  29.17 
 
 		 642 aa  50.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  23.96 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  26.41 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  33.03 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  27.19 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  25.53 
 
 		 756 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  24.73 
 
 		 1426 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  24.13 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  32.63 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25.53 
 
 		 652 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 249 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>