24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2719 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  939    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  55.22 
 
 
533 aa  497  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  24.5 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  28.4 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  28.02 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  27.82 
 
 
605 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  24.37 
 
 
642 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  22.68 
 
 
686 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  22.56 
 
 
718 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  26.7 
 
 
644 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  23.05 
 
 
528 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  27.13 
 
 
603 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 
486 aa  57.4  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  25.35 
 
 
354 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
383 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  22.54 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  32.18 
 
 
312 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  24.12 
 
 
480 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  22.97 
 
 
625 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  22.97 
 
 
625 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  26.64 
 
 
561 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  24.94 
 
 
589 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.24 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  25.94 
 
 
583 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>