35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1841 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1039    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  38.91 
 
 
528 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  36.58 
 
 
553 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  36.4 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  32.44 
 
 
561 aa  193  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  29.59 
 
 
686 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 
480 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  25.29 
 
 
644 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  25.89 
 
 
718 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  24.5 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.15 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.53 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  23.68 
 
 
642 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  21.82 
 
 
625 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  22.12 
 
 
625 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  23.26 
 
 
833 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
382 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  23.57 
 
 
605 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  25.34 
 
 
312 aa  62  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  22.13 
 
 
603 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  21.18 
 
 
660 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  26.04 
 
 
497 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  23.33 
 
 
652 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  23.87 
 
 
354 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  21.96 
 
 
756 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  25.26 
 
 
877 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  33.9 
 
 
215 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  20.99 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  22.03 
 
 
952 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  19.63 
 
 
913 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.53 
 
 
303 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  30.61 
 
 
365 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  27.83 
 
 
259 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>