36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2017 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1153    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  60.07 
 
 
561 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  53.75 
 
 
583 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  32.93 
 
 
605 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  30.96 
 
 
642 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  32.02 
 
 
644 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  36.7 
 
 
625 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  36.44 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  35.22 
 
 
660 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  32.84 
 
 
603 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
486 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  28.09 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.96 
 
 
833 aa  74.3  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  29.47 
 
 
354 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  26.33 
 
 
1327 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  22.12 
 
 
686 aa  64.3  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  25.15 
 
 
718 aa  62.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  24.82 
 
 
487 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  23.78 
 
 
480 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  24.79 
 
 
533 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.72 
 
 
1138 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  23.03 
 
 
952 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  26.22 
 
 
215 aa  55.1  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
1118 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  23.35 
 
 
497 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.61 
 
 
921 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  30.14 
 
 
756 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  23.75 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  43.75 
 
 
289 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  40.21 
 
 
430 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  22.84 
 
 
553 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.29 
 
 
316 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25.19 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  25.8 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
1421 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  24.94 
 
 
476 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>