75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0889 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1189    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  36.85 
 
 
644 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  38.42 
 
 
625 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  38.26 
 
 
625 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  37.07 
 
 
660 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  36.51 
 
 
642 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  36.5 
 
 
603 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  34.15 
 
 
561 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  33.16 
 
 
589 aa  229  8e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  33.11 
 
 
583 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.64 
 
 
921 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  27.24 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  26.49 
 
 
718 aa  84.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  26.96 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  27.81 
 
 
497 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  28.53 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  27.9 
 
 
833 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.22 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  25.69 
 
 
952 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  27.33 
 
 
1138 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  28.53 
 
 
1118 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  27.82 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  23.4 
 
 
686 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
1421 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  23.7 
 
 
553 aa  67.8  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25.23 
 
 
652 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.79 
 
 
316 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  24.36 
 
 
553 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  27.6 
 
 
533 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  29.26 
 
 
1426 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  23.57 
 
 
534 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  27.48 
 
 
756 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
1327 aa  61.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  24.27 
 
 
913 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  35.58 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  24.77 
 
 
877 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  31.52 
 
 
929 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1817  hypothetical protein  26.71 
 
 
637 aa  57.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  39.64 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  37.08 
 
 
289 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  51.61 
 
 
304 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  37.11 
 
 
338 aa  55.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  40.58 
 
 
203 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  41.54 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  30.28 
 
 
346 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  34.78 
 
 
259 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  36.19 
 
 
296 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.17 
 
 
514 aa  50.8  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  29.37 
 
 
179 aa  50.8  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 
465 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  34.95 
 
 
249 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  37.78 
 
 
255 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  40.91 
 
 
382 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  25.55 
 
 
1174 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  37.78 
 
 
255 aa  48.5  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  31.2 
 
 
559 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.4 
 
 
296 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  31.2 
 
 
563 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  31.2 
 
 
563 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  31.2 
 
 
559 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  34.33 
 
 
322 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  25.57 
 
 
1164 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  31.2 
 
 
563 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  31.2 
 
 
563 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  37.88 
 
 
350 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  31.31 
 
 
336 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  40 
 
 
402 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  31.31 
 
 
336 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  28.21 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  28.12 
 
 
293 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 
345 aa  44.3  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  34.85 
 
 
365 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>