63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5275 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1025    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  47.36 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  33.12 
 
 
521 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
525 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  27.95 
 
 
519 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  26.05 
 
 
551 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
529 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  25.43 
 
 
574 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  24.33 
 
 
571 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
680 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  26.54 
 
 
628 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0969  metallophosphoesterase  26.3 
 
 
664 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  22.82 
 
 
659 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00842  hypothetical protein  26.77 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00260286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06086  hypothetical protein  26.77 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  27.51 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
335 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  26.77 
 
 
320 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
318 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  24.17 
 
 
306 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
296 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
343 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
312 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.89 
 
 
306 aa  53.5  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  24.82 
 
 
314 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
1019 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  27.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  25 
 
 
314 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
299 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
299 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  24.47 
 
 
313 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
314 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  25.31 
 
 
309 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4358  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
365 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14426  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  25.83 
 
 
1174 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4300  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
365 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  25.3 
 
 
314 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
701 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  24.1 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.78 
 
 
229 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  25.9 
 
 
314 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  24.41 
 
 
374 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  31.82 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  22.17 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2833  metallophosphoesterase  26.71 
 
 
291 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  26.28 
 
 
322 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  27.01 
 
 
429 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>