24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1484 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  71.71 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  27.55 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  38.71 
 
 
1118 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  39.13 
 
 
1138 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  44.3 
 
 
718 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  35.64 
 
 
249 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  35.92 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  35.54 
 
 
480 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  38.6 
 
 
986 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 
345 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  34.4 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
303 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  35.34 
 
 
833 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  47.69 
 
 
952 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  40.24 
 
 
420 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  30.65 
 
 
350 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  23.23 
 
 
646 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  35.25 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  29.29 
 
 
346 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  27.88 
 
 
929 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  31.36 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  32.99 
 
 
402 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  34 
 
 
756 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>