More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1694 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
444 aa  864    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.21 
 
 
316 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  35.29 
 
 
324 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
733 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42.77 
 
 
304 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.09 
 
 
546 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
498 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  36.93 
 
 
544 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  37.43 
 
 
547 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  36.92 
 
 
277 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  36.5 
 
 
323 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  37.36 
 
 
307 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.56 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.52 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  32.45 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  40.19 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  31.61 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  31.61 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.81 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  33.72 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  37.06 
 
 
596 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  38.46 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.41 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  40.35 
 
 
563 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.84 
 
 
470 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.87 
 
 
255 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 
620 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 
527 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.62 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.43 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  39.47 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  33.52 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  37.57 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.68 
 
 
1001 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  32.75 
 
 
602 aa  73.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.62 
 
 
515 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  32.97 
 
 
514 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  37.56 
 
 
1021 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.87 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.41 
 
 
840 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  41.75 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  30.47 
 
 
257 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  33.7 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.46 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  30.22 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 
1079 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  40.18 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  34.64 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  30.22 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  30.22 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  30.22 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  29.35 
 
 
849 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  32.41 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  38.07 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  32.41 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  27.66 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.1 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.86 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 
539 aa  67  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.52 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.61 
 
 
354 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.22 
 
 
534 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  30.6 
 
 
571 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  30.81 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  33.33 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.26 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  34.19 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  35.16 
 
 
474 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  41.18 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.62 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.1 
 
 
554 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  41.18 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 
292 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  28.65 
 
 
517 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  30.56 
 
 
265 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.05 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  32.41 
 
 
265 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.74 
 
 
568 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  38.1 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 
517 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>