39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0812 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  48.79 
 
 
309 aa  278  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  42.08 
 
 
269 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  48.02 
 
 
250 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  43.33 
 
 
246 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  44.71 
 
 
248 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  43.44 
 
 
249 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  40.56 
 
 
255 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  38.64 
 
 
258 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  38.64 
 
 
257 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  42.03 
 
 
238 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  33.57 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  39.11 
 
 
317 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  35.65 
 
 
258 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  41.38 
 
 
251 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  38.91 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  35.25 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  34.43 
 
 
256 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  37.95 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  36.15 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  35.38 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  35.5 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  35.19 
 
 
274 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  37.05 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  32.75 
 
 
244 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  32.65 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  32.65 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  32.97 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  34.84 
 
 
266 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>