40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2204 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  91.63 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  91.21 
 
 		 257 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  78.54 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  73.82 
 
 		 246 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  73.25 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  52.38 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  48.95 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  48.42 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  46.88 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  46.48 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  45.53 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  48.47 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  43.46 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  44.31 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  45.99 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  48.33 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  48 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  44.4 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  44.4 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  45.41 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  43.23 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  38.66 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  46.37 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  38.77 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  38.77 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  38.77 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  38.77 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  36.18 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  38.33 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  36.06 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  39.89 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  39.89 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  32.37 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  35.75 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  25.91 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  31.51 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  31.51 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  26.94 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4279  f161  38.71 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>