35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4035 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  54.96 
 
 
257 aa  278  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  56.11 
 
 
245 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  55.26 
 
 
251 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  51.85 
 
 
245 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  51.85 
 
 
245 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  45.3 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  46.12 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  44.3 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  45.37 
 
 
257 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  46.85 
 
 
250 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  45.37 
 
 
258 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  42.86 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  46.95 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  46.19 
 
 
274 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  38.21 
 
 
269 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  41.06 
 
 
256 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  41.06 
 
 
256 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  40.08 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  36.68 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  38.91 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  33.02 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  37.56 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  39.69 
 
 
317 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  28.5 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  28.33 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0140439 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  31.07 
 
 
254 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  31.07 
 
 
254 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  31.07 
 
 
254 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  31.07 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  29.73 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0489181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>