39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2800 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  60.36 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  55.82 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  55.42 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  55.26 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  53.74 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  48.75 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  49.37 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  49.36 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  49.55 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  47.03 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  45.76 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  47.98 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  48.34 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  44.1 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  44.2 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  42.19 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  41.89 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  41.89 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  39.06 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  38.91 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  41.38 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  41.45 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  40.54 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  33.18 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  32.05 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  33.51 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  31.62 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  31.62 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  31.62 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  34.64 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  31.62 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  31.61 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  27.39 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  27.39 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  23.84 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  23.84 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>